بازنمایی اطلاعات ژنومی

توسعه فناوری‌های توالی‌یابی نسل بعدی (NGS) استفاده از اطلاعات ژنومی را به عنوان فعالیتی روزمره در چندین زمینه ممکن می‌سازد، اما حجم فزاینده داده‌های تولید شده به مانعی جدی برای انتشار گسترده آن تبدیل می‌شود. نمایش مناسب و فشرده سازی کارآمد داده های ژنومی به عنوان یک عنصر حیاتی که فقدان آن پتانسیل کاربرد این اطلاعات را محدود می کند، شناخته شده است. علاوه بر فشرده‌سازی که اساس پردازش کارآمد اطلاعات ژنومی است، چندین الزام دیگر وجود دارد که توسط قالب‌های داده فعلی برای داده‌های خام و هم‌تراز شده برآورده نمی‌شوند. ISO/TC 276 و MPEG تخصص و ماموریت های مربوطه خود را با هم ترکیب کرده اند و با توسعه سری استاندارد ISO/IEC 23092 که به عنوان MPEG-G نیز شناخته می شود، به مشکل نوظهور مدیریت مقادیر زیادی از داده های توالی ژنومی پرداخته اند. این سری استاندارد مشخصات یک فایل و فرمت انتقال (قسمت 1)، فناوری فشرده سازی (قسمت 2)، مشخصات ابرداده، پشتیبانی حفاظتی و APIهای استاندارد را برای دسترسی به داده های توالی در قالب فشرده بومی (بخش 3) ارائه می دهد.

مطابق با روش سنتی MPEG برای بهبود مستمر کیفیت و عملکرد استانداردهای خود، MPEG همچنین نسخه جدیدی از قسمت 1 و 2 و مشخصات جدید قسمت 4 "نرم افزار مرجع" و قسمت 5 "انطباق" را تکمیل کرد. چنین اجزایی از سری استاندارد MPEG-G پشتیبانیهای لازم برای کسانی که مایل به پیاده سازی استاندارد هستند یا علاقه مند به تأیید صحت و قابلیت تبادل پیاده سازی های خود هستند، را فراهم می کند.

در مقایسه با نسخه اول، ویرایش های دوم ISO/IEC 23092-1 و ISO/IEC 23092-2 با در نظر گرفتن نظرات دریافت شده از کاربران بهبود یافته است.

استاندارد ISO/IEC 23092-4 نرم افزار مرجع MPEG-G پیاده سازی منطبق با استاندارد را ارائه می دهد. در ارتباط با استاندارد ISO/IEC 23092-5 (مطابقت با MPEG-G)، لازم به ذکر است که این بخش از استاندارد پشتیبانی جامع از الزامات و اعتبارسنجی برای توسعه پیاده‌سازی کدگشاهای منطبق با استاندارد ارائه می‌کند. قابلیت همکاری برنامه های کاربردی مبتنی بر فرآیندهای کدگشایی منطبق با استانداد با یک فرآیند کدگشای مرجع و مجموعه ای غنی از آزمایش ها و مراجع طلایی مربوطه بوسیله این بخش از استاندارد تسهیل می شود.

اشتراک در
اطلاع از
guest
0 Comments
قدیمی‌ترین
تازه‌ترین بیشترین رأی
بازخورد (Feedback) های اینلاین
مشاهده همه دیدگاه ها